Moral ist das Maß der Zuversicht einer Einheit im Gefecht. Während langanhaltender Nahkämpfe wird die Moral der Männer stark auf die Probe gestellt und sie werden den Rang brechen und fliehen, wenn sie zu niedrig sinkt. Dies wird durch den farbigen Balken über dem Banner jeder Einheit angezeigt: Ist er grün, verfügt die Einheit über eine gesunde Moral, wird er gelb, ist eine Moraleinbuße vorhanden und wird er schließlich rot, so schwankt die Einheit und steht kurz vor Rangbruch und Flucht. Allein die Anwesenheit des Generals kann die Moral erhöhen und gut ausgebildete Elite-Einheiten haben von vorneherein eine weitaus höhere Moral. Helden erhöhen außerdem die Moral nahestehender Einheiten durch ihre Anwesenheit. Generäle können ihre Männer durch ihre Neu gruppieren, Motivieren, und Ermutigen Sonderfertigkeiten effektiver sammeln.
Die Einheit oder Schiffsbesatzung, deren Moral aufgrund von Verlusten, Erschöpfung oder einer überwältigenden Anzahl von Feinden gebrochen ist, wird die Flucht ergreifen, d.h. nicht mehr weiterkämpfen und das Schlachtfeld verlassen. Die fliehenden Soldaten können versammelt werden - entweder durch Anwesenheit eines Generals oder seine Sammeln-Fertigkeit.
Es besteht die Chance, fliehende Einheiten oder Schiffe mit der Sammeln-Fertigkeit des Generals dazu zu bewegen, auf dem Schlachtfeld zu bleiben. Wählt hierzu den General aus und klickt auf das Sammeln-Feld. Die Flüchtenden müssen sich hierzu im Wirkungsradius des Generals befinden. Einheiten, deren Moral erschüttert ist, werden nicht auf den Ruf des Generals reagieren.
Wird ein General in einem Gefecht getötet, während Einheiten oder Schiffe fliehen, zerstreuen sie sich und können sich fortan nicht mehr sammeln. Alle Einheiten und Schiffe, die nach dem Tod eines Generals fliehen, sind automatisch zerstreut, und auch die Anwesenheit eines Generals von niedrigerem Rang kann dies nicht mehr verhindern. Armeen oder Flotten, die sich ohne General im Feld befinden, werden immer zerstört, wenn sie in die Flucht geschlagen werden.